Нашелся плагин, который теоретически решает одну из самых больших проблем Joomla, связанную с дублированием контента. Дело в том, что в Joomla присутствуют динамические ссылки типа /?option=com_content&view=article&id=xxx и сгенерированные с помощью внутреннего SEF.
Плагин называется NSTS - Non-SEF to SEF.
https://joomla-extensions.kubik-rubik.de
Для Joomla 2.5 можно скачать с гитхаба автора плагина.
https://github.com/Kubik-Rubik/NSTS-Non-SEF-To-SEF
Плагин не создает SEO ссылки, он берет их из Joomla.
Во многих случаях динамический адрес является нежелательным. Например, если поисковый сервер видит динамические адреса, то нежелательные URL-адреса отображаются в результатах поиска. NSTS перенаправляет такие URL со статусом 301 на постоянное местоположение.
Также можно посмотреть подборку плагинов для Joomla, оптимизацию производительности и рекомендации по SEO для Joomla.
UPD.
Плагин оказался не один. Вот еще аналоги:
Есть бесплатная версия, есть платные различной степени функциональности.
В бесплатной есть настройка 404 страницы, редиректы, сайтмап, теги и прочее.
Стало платным.
Тут можно почитать про настройку.
Простой редиректор. Начальный URL --> конечный URL.
shnodoubles
Плагин Joomla, убирает дубли.
Мануал по настройке
http://joomla-service.in.ua/plaginy/plagin-shnodoubles-ubrayushchij-dubli-stranits-v-joomla
No Doubles
http://joomline.ru/rasshirenija/plugin/jlnodubles.html
Наподобие shnodoubles.
Платная поддержка Zoo, k2, Virtuemart.
В рамках исследования работоспособности плагинов только последний заработал без шаманств.